Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms