Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBL1P28749 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms