Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFLP07196 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFLP07196 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms