Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNN4O15554 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNN4O15554 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNN4O15554 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNN4O15554 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KCNN4O15554 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNN4O15554 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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