Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms