Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms