Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP74Q9C0B2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms