Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms