Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms