Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GORASP1Q9BQQ3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms