Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAP1Q96P48 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms