Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C8orf49Q96NF6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms