Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms