Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms