Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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