Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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