Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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