Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms