Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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