Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms