Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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