Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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