Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms