Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms