Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms