Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms