Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms