Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN9O95484 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN9O95484 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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