Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NABP2-205ENST00000447747 770 ntTSL 510.49□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 OS9-214ENST00000550438 635 ntTSL 210.31□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 ZNF252P-203ENST00000527222 876 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-246ENST00000640268 3804 ntTSL 59.96□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 GRB10-213ENST00000461886 624 ntTSL 29.95□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RFX3-209ENST00000451859 740 ntTSL 39.52□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC9.42□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-209ENST00000587942 2177 ntTSL 29.13□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 ZNF252P-206ENST00000529315 575 ntTSL 58.83□□□□□ -13e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -13e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 XRRA1-209ENST00000528819 412 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.136e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-228ENST00000638904 3646 ntTSL 57.68□□□□□ -1.183e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-224ENST00000638424 3708 ntTSL 57.25□□□□□ -1.253e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 DTYMK-204ENST00000432348 926 ntTSL 57.13□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-249ENST00000640682 2412 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 LCP2-205ENST00000520344 666 ntTSL 56.3□□□□□ -1.43e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RAB5B-209ENST00000551459 569 ntTSL 46.09□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 TTC17-203ENST00000418561 575 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.53e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 TTC17-207ENST00000525543 3142 ntTSL 25.65□□□□□ -1.53e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.533e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.48□□□□□ -1.533e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RNF217-206ENST00000454842 545 ntTSL 45.37□□□□□ -1.553e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 MBIP-207ENST00000604160 621 ntTSL 55.01□□□□□ -1.613e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.628e-7■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 PIGN-244ENST00000640248 1584 ntTSL 54.91□□□□□ -1.623e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.774e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 RNF217-208ENST00000519799 450 ntTSL 41.49□□□□□ -2.173e-9■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 327.49■■□□□ 1.991e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SMARCAD1-203ENST00000394961 3778 ntTSL 26.92□□□□□ -1.36e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.076e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 SMARCAD1-202ENST00000359052 5017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)1.76□□□□□ -2.136e-6■■■■■ 93.6
SF3B1O75533 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COCH-209ENST00000555881 782 ntTSL 223.72■■□□□ 1.398e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.28e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.998e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 93.5
SF3B1O75533 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 93.4
SF3B1O75533 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 93.4
SF3B1O75533 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 LINC01748-201ENST00000439156 1798 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 324.77■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 424.06■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 419.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 93.3
SF3B1O75533 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 510.58□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 528.03■■■□□ 2.082e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 423.97■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 213.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-225ENST00000560005 699 ntTSL 322.49■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-207ENST00000553599 591 ntTSL 420.79■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-210ENST00000554131 591 ntTSL 319.83■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-208ENST00000553719 712 ntTSL 219.37■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-218ENST00000556864 574 ntTSL 518.96■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-212ENST00000555254 754 ntTSL 318.58■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-217ENST00000556533 550 ntTSL 518.57■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-206ENST00000553447 572 ntTSL 418.56■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-224ENST00000559361 795 ntTSL 518.14■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-220ENST00000557037 555 ntTSL 414□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-221ENST00000557293 576 ntTSL 213.95□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-219ENST00000556951 552 ntTSL 213.95□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 PSEN1-222ENST00000557356 571 ntTSL 48.57□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.176e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-6■■■■■ 93.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1273.6 ms