Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PCH4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PCH4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PCH4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms