Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms