Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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