Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEU3Q9UQ49 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms