Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms