Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms