Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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