Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms