Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDXQ7Z353 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms