Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms