Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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