Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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SHROOM2Q13796 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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SHROOM2Q13796 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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SHROOM2Q13796 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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SHROOM2Q13796 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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