Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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