Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFI35P80217 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms