Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K9P80192 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K9P80192 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms