Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CASP9P55211 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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