Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms