Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNA2P51530 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms