Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGS4P49798 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms