Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ME1P48163 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ME1P48163 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ME1P48163 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ME1P48163 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms