Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms